Thema: Hoge-energieastrofysica
In de afgelopen jaren heeft de röntgenastronomie zich verbreed tot hoge-energieastrofysica. Dit thema richt zich op het onderzoek naar relativistische compacte objecten, de bijbehorende energetische verschijnselen en de ruimtetijdnatuurkunde.
Thema: Oorsprong van het leven
De stellaire astrofysica is van oudsher een speerpunt binnen het Anton Pannekoek Instituut. Het is nu onderdeel van het bredere thema naar de oorsprong van het leven. Dit thema omvat de vorming en evolutie van sterren en sterpopulaties en het onderzoek naar planeetvorming en planeten met de nadruk op hun atmosferen.